Acidi nucleici

 

Core Facilities di riferimento

Analitica biochimica-biofisica; Tecnologie omiche e computazionali

Biosafety level 2 per colture cellulari, virus e batteri

Biosafety level 3 - BSL3

Scopo

Ricerca e sviluppo di composti antivirali, antibatterici e antitumorali con un meccanismo d'azione innovativo.

Caratterizzazione del ruolo biologico di strutture secondarie di acidi nucleici (es G-quadruplex, i-Motifs).

Ambiti/Linee di ricerca

  • identificazione e caratterizzazione funzionale di strutture secondarie di acidi nucleici in genomi virali e batterici
  • identificazione e caratterizzazione funzionale di strutture secondarie di acidi nucleici coinvolte&nbspnella patogenesi del cancro e di malattie neurodegenerative
  • sviluppo di composti antivirali/antibatterici/antitumorali che abbiano come bersaglio strutture secondarie di acidi nucleici funzionalmente rilevanti

Attività

Analisi biochimica e biofisica: spettrometria UV/Vis, fluorescenza, dicroismo circolare, fluorescence resonance energy transfer (FRET), fluorescence intercalator displacement assay (FID), surface plasmon resonance (SPR), fotoattivazione, footprinting chimico ed enzimatico.
Tecniche e saggi mediante sull'uso di radioisotopi.
Tutte le maggiori tecniche di biologia molecolare e cellulare: manipolazione ed analisi di acidi nucleici, cloning, purificazione ed analisi di proteine, saggi reporter, saggi cellulari di interazioni proteina-proteina, gel elettroforesi nativa e denaturante, tecniche di blotting, microscopia confocale, saggi di citotossicità, analisi del ciclo cellulare, immunofluorescenza, saggi di pull-down.
Tecniche di genome-wide analysis e sequencing, e relativa analisi bioinformatica: ChIP-seq, ChIP-qPCR, CUT&RUN, CUT&Tag.

Collaborazioni

  • Nazionali
    • Prof Stefano Alcaro, University of Catanzaro, Italy
    • Prof Also Galeone, University of Naples, Italy
    • Prof Mauro Freccero, University of Pavia, Italy
    • Dott.ssa Nadia Zaffaroni, Istituto Nazionale dei Tumori, Milan, Italy
  • Internazionali
    • Prof Laurence Hurley, The University of Arizona, Tucson, Arizona, USA
    • Prof David Monchaud, Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne, Dijon, France
    • Prof Stephen Neidle, School of Pharmacy, University College London, UK
    • Prof Janez Plavec, National Institute of Chemistry and University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia
    • Prof Gunnar Schotta, Ludwig-Maximilians-University, Planegg-Martinsried, Germany

Sede

Sede di Microbiologia
via Gabelli 63, 35121 Padova, Italy
Google Maps

Responsabile

Prof.ssa Sara Richter

Staff/Persone

  • Dott.ssa Ilaria Frasson, Assistant Professor
  • Dott. Matteo Nadai, technician
  • Dott.ssa Emanuela Ruggiero, post-doc
  • Dott.ssa Giulia Nicoletto, PhD student
  • Dott.ssa Beatrice Tosoni, PhD student
  • Dott.ssa Ilaria Maurizio, PhD student
  • Dott.ssa Irene Zanin, PhD student
  • Dott.ssa Marianna Terreri, PhD student
  • under-graduate students